财政部南区国税局表示，企业出售持有满三年的股票，获利减掉损失后，若仍有所得，在计算基本所得额（最低税负）时，仅须以半数计入，可有效降低税负。

不少企业会利用闲置资金投资股票、ETF等，希望增加营业外收益。依《所得基本税额条例》规定，营利事业的基本所得额，是以课税所得额加计部分免税所得计算，其中就包括证券及期货交易所得，都必须纳入，计算最低税负。

南区国税局解释，为鼓励企业长期投资，自2013年起，若出售持有满三年以上的股票，在计算当年度证券交易所得时，减除当年度出售该持有满三年以上股票的交易损失后，剩余的交易所得只需半数计入证券交易所得；若持股未满三年，则必须全数计入，两者税负差异不小。

能否享有这项租税优惠，持股期间认定方式也是关键。国税局指出，股票出售时并非由企业自行挑选出售哪一批股票，而是必须依照「先进先出法（FIFO）」计算，也就是最早买进的股票，视为最先出售，代表即使帐面上持有相同公司股票，只要买进时间不同，是否符合持有满三年的优惠资格，也可能有所不同。

举例来说，甲公司于2024年底出售上市公司股票4万股，获利1,000万元，申报时将全数列入证券交易所得，经国税局查核交易明细后发现，其中3万股是在2021年1月取得，持有已满三年，获利800万元；另外1万股则于2023年5月取得，持有未满三年，获利200万元。依规定，持有满三年的800万元，只需以半数400万元计入证券交易所得；未满三年的200万元则须全数计入，因此甲公司应计入基本所得额的证券交易所得为600万元，而非原本自行申报的1,000万元，最后经国税局重新核定后，退还多缴的税款。

国税局提醒，企业平时应妥善保存股票交易纪录，出售股票时也要依规定采先进先出法计算持有期间，确认哪些股票符合长期持有优惠，才能正确申报并享有租税优惠。